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La plateforme MRI est la plateforme d’imagerie cellulaire de la région Montpelliéraine. Elle offre un accès à une instrumentation de pointe en Microscopie optique et électronique, Cytométrie en flux et microtomographie RX.
Plus de 30 ingénieurs sont au service d’environ 750 utilisateurs actifs. Les appareils sont répartis sur 7 sites, miroir de la distribution des campus de recherche en Sciences de la Vie de la région. L’objectif de MRI est de soutenir la recherche en offrant les appareils d’imagerie et les solutions d’analyse les plus récentes.
Portfolio d’applications :
Les applications de l’Imagerie dans le domaine des Sciences du Vivant sont très nombreuses.
En voici quelques-unes :
- Etudes d’ultrastructures,
- Identifications d’événements/cellules rares (comme les CTC), de sous-populations par cytométrie en flux ou microscopie automatisée,
- Clonage de cellules d’intérêt, isolement de tissus pour analyse protéomique ou génomique,
- Imagerie de tissus durs et analyse morphologiques, incluant la morphologie comparative et la création d’atlas anatomiques virtuels,
- Reconstructions en 3D d’objets (d’ultrastructures à des échantillons centimétriques),
- Etudes dynamiques de fonctions biologiques.
Principale expertise/Services :
- Tri cellulaire paramétrique
- µTomographie RX et reconstruction 3D
- F-techniques en microscopie optique (FRAP, photoactivation, FLIM, FRET, FLIM, FCS)
- Observation de la milliseconde à la semaine
- Observation en super-résolution (SIM, PALM)
- Microscopie électronique à balayage et à transmission et tomographie 3D
- Microscopie à grande échelle (criblage HCS, lame virtuelle, Serial Block Face Imaging)
- Imagerie des lipides, des protéines et des métabolites secondaires sans marquages
- Automatisation de l’analyse d’images, stockage et analyse à distance des données
Nous développons des solutions originales non commerciales telles que des microscopes super-résolution (SIM, PALM) ainsi que des outils d’analyse ou de gestion d’images innovants.
Politique d’accès et de prestations :
Nous nous engageons à fournir aux utilisateurs les techniques les plus avancées et complètes. Nos services vont ainsi des conseils dans la mise en place expérimentale et le choix des appareils, la formation et l’aide à l’utilisation des appareils, jusqu’à l’analyse finale des images/données.
MRI est ouverte au secteur privé et au secteur académique sans aucune restriction thématique, institutionnelle ou géographique. Les utilisateurs opèrent eux-mêmes les équipements, à l’exception à l’exception des trieurs cellulaires haute vitesse par cytométrie en flux. L’accès aux équipements, payant, n’est pas conditionné par l’établissement d’une collaboration.
MRI fait partie du nœud France-BioImaging Montpellier, infrastructure nationale dédiée aux techniques en imagerie en biologie (PIA). Elle est labellisée GPTR et IBiSA et certifiée ISO 9001 et NFX 50-900 pour l’ensemble de ses prestations en microscopie optique, cytométrie en flux et microtomographie RX.
Publications
Notes d'applications :
site de la plateforme
Organigramme de la Plateforme MRI :
Direction de la plateforme MRI
Responsable Scientifique :
- Patrick LEMAIRE
(DR, CNRS, 15%)
Responsable opérationnel :
- Virginie GEORGET
(IR, CNRS, 70%)
+-
Comité de Direction
- Carine ALCON
- Volker BAECKER
- Laurence BERRY
- Marie-Pierre BLANCHARD
- Benoit BORDIGNON
- Myriam BOYER-CLAVEL
- Matthieu DEJEAN
- Cécile DEJOU
- Christophe DUPERRAY
- Orestis FAKLARIS
- Jérémy GALTIER
- Carole GAURON
- Virginie GEORGET
- Renaud LEBRUN
- Patrick LEMAIRE
- Olivier MIQUEL
- Chamroeun SAR
- Céline TALIGNANI
- Paraskevi VERDIN-DIAKOU
+-
Comité d'orientation scientifique et technique
Experts externes :
- Jean-Louis BESSEREAU ( Président COST, MeLis, Lyon )
- Frédéric BRAU ( IPMC, Nice )
- Olivier LANTZ ( Institut Curie, Paris )
- Dimitri MOREAU ( ACCESS, Genève )
- David ROUSSEAU ( IRHS, Angers )
- Willy SUPATTO ( LOB, Palaiseau )
- Jean-Yves TINEVEZ ( Institut Pasteur, Paris )
Experts locaux :
- Daphné AUTRAN ( DIADE, Montpellier )
- Florence BERNEX ( BCM, Montpellier )
- Mattéo BONAZZI ( IRIM, Montpellier )
- Cyril FAVARD ( IRIM, Montpellier )
- Lionel HAUTIER ( ISEM, Montpellier )
- Mar NARANJO ( IRMB, Montpellier )
+-
Correspondant
- Finances : Marie-Pierre BLANCHARD
- Recherche et Developement : Julio MATEOS-LANGERAK
- Formation : Paraskevi VERDIN-DIAKOU
+-
Département Optique
MRI-CRBM
Responsable :
- Orestis FAKLARIS
(IR, CNRS, 100%)
Personnel plateau permanent :
- Sylvain DE ROSSI
(IR, INSERM, 100%)
- Virginie GEORGET
(IR, CNRS, 30%)
Personnel plateau CDD :
- Soumaya TURPAULT
(CDD IE, CNRS, 100%)
MRI-IGH
Responsable :
- Marie-Pierre BLANCHARD
(IR, CNRS, 100%)
Personnel plateau permanent :
- Julien CAU
(IR, CNRS, 30%)
- Julio MATEOS-LANGERAK
(IR, CNRS, 100%)
- Baptiste MONTERROSO
(IE, CNRS, 100%)
Personnel plateau CDD :
- Jérémy GALTIER
(CDD IE, CNRS, 50%)
MRI-DBS-UM
Responsable :
- Paraskevi VERDIN-DIAKOU
(IE, UM, 95%)
Personnel plateau permanent :
- Elodie JUBLANC
(IE, INRAE, 50%)
MRI-INM
Responsable :
- Chamroeun SAR
(IE, UM, 100%)
Personnel plateau permanent :
- Laetitia HUDECEK
(AI, INSERM, 100%)
MRI-PHIV-LA GAILLARDE
Responsable :
- Carine ALCON
(IE, CNRS, 50%)
MRI-PHIV-Lavalette
Responsable :
- Matthieu DEJEAN
(T, CIRAD, 20%)
Personnel plateau permanent :
- Sergi NAVARRO-SANZ
(T, CIRAD, 5%)
MRI-PHIV-DIADE
Responsable :
- Carole GAURON
(IE, IRD, 50%)
MRI-IRCM
Responsable :
- Céline TALIGNANI
(AI, UM, 50%)
Equipe resp scientifique
Responsable :
- Patrick LEMAIRE
(DR, CNRS, 5%)
Personnel plateau CDD :
- Benjamin GALLEAN
(CDD IE, UM, 100%)
+-
Département Cytométrie
MRI-IGMM
Responsable :
- Myriam BOYER-CLAVEL
(IE, CNRS, 100%)
Personnel plateau permanent :
- Stephanie VIALA
(IE, CNRS, 100%)
MRI-IRMB
Responsable :
- Christophe DUPERRAY
(IR, INSERM, 100%)
Personnel plateau CDD :
- Felicia LECCIA
(CDD IE, CNRS, 100%)
MRI-IRCM
Responsable :
- Cécile DEJOU
(IE, INSERM, 50%)
MRI-IGH
Responsable :
- Jérémy GALTIER
(CDD, IE, CNRS, 50%)
+-
Dept Criblage
Responsable :
- Benoit BORDIGNON
(IR, CNRS, 100%)
Personnel plateau permanent :
- Cedric HASSEN-KHODJA
(IE, CNRS, 100%)
+-
Informatique
Responsable :
- Olivier MIQUEL
(IE, CNRS, 100%)
Personnel plateau CDD :
- Thierry ALBAREDA
(CDD AI, CNRS, 100%)
- Dominique GOUBET
(CDD IE, CNRS, 100%)
+-
Microscopie Électronique
Responsable :
- Laurence BERRY
(IR, CNRS, 50%)
Personnel plateau CDD :
- Salomé BELEC
(CDD T, UM, 100%)
- Lucien DAUNAS
(CDD IE, CNRS, 100%)
+-
Analyse Image
Responsable :
- Volker BAECKER
(IR, INSERM, 100%)
Personnel plateau CDD :
- Clément BENEDETTI
(CDD IE, CNRS, 100%)
+-
Direction de la plateforme MRI
- Patrick LEMAIRE (DR, CNRS, 15%)
Responsable Scientifique :
- Virginie GEORGET (IR, CNRS, 70%)
Responsable opérationnel :
Comité de Direction
- Carine ALCON
- Volker BAECKER
- Laurence BERRY
- Marie-Pierre BLANCHARD
- Benoit BORDIGNON
- Myriam BOYER-CLAVEL
- Matthieu DEJEAN
- Cécile DEJOU
- Christophe DUPERRAY
- Orestis FAKLARIS
- Jérémy GALTIER
- Carole GAURON
- Virginie GEORGET
- Renaud LEBRUN
- Patrick LEMAIRE
- Olivier MIQUEL
- Chamroeun SAR
- Céline TALIGNANI
- Paraskevi VERDIN-DIAKOU
Comité d'orientation scientifique et technique
- Jean-Louis BESSEREAU ( Président COST, MeLis, Lyon )
- Frédéric BRAU ( IPMC, Nice )
- Olivier LANTZ ( Institut Curie, Paris )
- Dimitri MOREAU ( ACCESS, Genève )
- David ROUSSEAU ( IRHS, Angers )
- Willy SUPATTO ( LOB, Palaiseau )
- Jean-Yves TINEVEZ ( Institut Pasteur, Paris )
Experts externes :
- Daphné AUTRAN ( DIADE, Montpellier )
- Florence BERNEX ( BCM, Montpellier )
- Mattéo BONAZZI ( IRIM, Montpellier )
- Cyril FAVARD ( IRIM, Montpellier )
- Lionel HAUTIER ( ISEM, Montpellier )
- Mar NARANJO ( IRMB, Montpellier )
Experts locaux :
Correspondant
- Finances : Marie-Pierre BLANCHARD
- Recherche et Developement : Julio MATEOS-LANGERAK
- Formation : Paraskevi VERDIN-DIAKOU
Département Optique
- Orestis FAKLARIS (IR, CNRS, 100%)
MRI-CRBM
Responsable :
- Sylvain DE ROSSI (IR, INSERM, 100%)
- Virginie GEORGET (IR, CNRS, 30%)
Personnel plateau permanent :
- Soumaya TURPAULT (CDD IE, CNRS, 100%)
Personnel plateau CDD :
- Marie-Pierre BLANCHARD (IR, CNRS, 100%)
MRI-IGH
Responsable :
- Julien CAU (IR, CNRS, 30%)
- Julio MATEOS-LANGERAK (IR, CNRS, 100%)
- Baptiste MONTERROSO (IE, CNRS, 100%)
Personnel plateau permanent :
- Jérémy GALTIER (CDD IE, CNRS, 50%)
Personnel plateau CDD :
- Paraskevi VERDIN-DIAKOU (IE, UM, 95%)
MRI-DBS-UM
Responsable :
- Elodie JUBLANC (IE, INRAE, 50%)
Personnel plateau permanent :
- Chamroeun SAR (IE, UM, 100%)
MRI-INM
Responsable :
- Laetitia HUDECEK (AI, INSERM, 100%)
Personnel plateau permanent :
- Carine ALCON (IE, CNRS, 50%)
MRI-PHIV-LA GAILLARDE
Responsable :
- Matthieu DEJEAN (T, CIRAD, 20%)
MRI-PHIV-Lavalette
Responsable :
- Sergi NAVARRO-SANZ (T, CIRAD, 5%)
Personnel plateau permanent :
- Carole GAURON (IE, IRD, 50%)
MRI-PHIV-DIADE
Responsable :
- Céline TALIGNANI (AI, UM, 50%)
MRI-IRCM
Responsable :
- Patrick LEMAIRE (DR, CNRS, 5%)
Equipe resp scientifique
Responsable :
- Benjamin GALLEAN (CDD IE, UM, 100%)
Personnel plateau CDD :
Département Cytométrie
- Myriam BOYER-CLAVEL (IE, CNRS, 100%)
MRI-IGMM
Responsable :
- Stephanie VIALA (IE, CNRS, 100%)
Personnel plateau permanent :
- Christophe DUPERRAY (IR, INSERM, 100%)
MRI-IRMB
Responsable :
- Felicia LECCIA (CDD IE, CNRS, 100%)
Personnel plateau CDD :
- Cécile DEJOU (IE, INSERM, 50%)
MRI-IRCM
Responsable :
- Jérémy GALTIER (CDD, IE, CNRS, 50%)
MRI-IGH
Responsable :
Dept Criblage
- Benoit BORDIGNON (IR, CNRS, 100%)
Responsable :
- Cedric HASSEN-KHODJA (IE, CNRS, 100%)
Personnel plateau permanent :
Informatique
- Olivier MIQUEL (IE, CNRS, 100%)
Responsable :
- Thierry ALBAREDA (CDD AI, CNRS, 100%)
- Dominique GOUBET (CDD IE, CNRS, 100%)
Personnel plateau CDD :
Microscopie Électronique
- Laurence BERRY (IR, CNRS, 50%)
Responsable :
- Salomé BELEC (CDD T, UM, 100%)
- Lucien DAUNAS (CDD IE, CNRS, 100%)
Personnel plateau CDD :
Analyse Image
- Volker BAECKER (IR, INSERM, 100%)
Responsable :
- Clément BENEDETTI (CDD IE, CNRS, 100%)
Personnel plateau CDD :