MDC permet l’accès à la technique de peignage moléculaire de l’ADN pour l'analyse sur molécules individuelles des chromosomes eucaryotes. Elle est unique dans le monde universitaire et attire des clients au niveau national et international. Le peignage moléculaire permet d’étirer et d’aligner de façon uniforme de longues fibres d’ADN sur des lamelles silanisées. Ces fibres peuvent ensuite être analysées par microscopie de fluorescence (FISH, immunofluorescence).

Portfolio d’applications :

• Etude de micro-remaniements des chromosomes,
• étude fine de la dynamique de réplication des chromosomes. Les cellules en cours de réplication sont pulsées avec des analogues de la thymidine (IdU, CldU). L’incorporation des analogues est détectée par des anticorps spécifiques couplés à des fluorophores distincts, le long des molécules individuelles d’ADN pouvant atteindre 2 Mb de long. Les distances moyennes entre origines de réplication, leur densité globale, la vitesse des fourches de réplication ainsi que leurs défauts de progression sont déterminés de façon quantitative, à haute résolution, à l’échelle du génome entier, mais au niveau de molécules individuelles.

Un atout décisif du peignage moléculaire, en comparaison avec les techniques courantes d’analyse, est de ne pas moyenner les valeurs obtenues sur la population. Cela permet par exemple de détecter des altérations subtiles de la réplication, impossible à observer par ailleurs.

Principale expertise/Services :

• Production, contrôle qualité et distribution de lamelles de verre silanisées,
• Réalisation d'analyses biologiques complètes (de la préparation de l'ADN jusqu'aux mesures de paramètres de la dynamique de la réplication et tests statistiques) en collaboration,
• Analyses d'images de peignage avec notre logiciel dédié d'analyse IDeFIx, crée par la plateforme,
• Formation du personnel à la technique de peignage moléculaire (depuis la silanisation des lames jusqu’à l’analyse informatique des données, en passant par le marquage des cellules, la préparation de l’ADN et le peignage).

Politique d’accès et de prestations :

La fourniture de lames silanisées est réservée aux laboratoires CNRS. Les autres services sont ouverts à tout utilisateur, académique ou privé). Nous offrons des analyses complètes de réplication sur une base collaborative. Les autres prestations sont payantes.

Publications

Notes d'applications :

site de la plateforme

Organigramme de la Plateforme MDC :