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PIBBS est une plateforme « ressource de recherche » pour la communauté scientifique locale, nationale et internationale. Elle fournit l'expertise scientifique de son personnel et un ensemble d’équipements de pointe. La spécificité de la plateforme, et son atout majeur, est de combiner des approches de biologie structurale à la fine pointe de la technologie (RMN, RX, ME, Bio / chimio-informatique) et les technologies de la biophysique (AFM, microscopie à fluorescence en molécules uniques et spectroscopie). Ainsi, son originalité est de fournir une approche complètement multidisciplinaire et intégrée pour comprendre les relations structure-fonction dans les biomolécules.
Portfolio d’applications :
- Etudes de structures et analyse structurale d’interactions protéine/protéine ou acide nucléique/protéine,
- Etude de la dynamique biomoléculaire et des interactions in vitro et in vivo (repliement, assemblage, localisation, diffusions, changement de conformation)
- Développement de médicaments à l'aide d'approches basées sur des fragments et de la chimie click.
- Topographie et mesures des propriétés mécaniques d’échantillons biologiques,
- Etudes structure/fonction.
Principale expertise/Services :
- Analyse bio-informatique. Nous développons des outils de modélisation structurelle à homologie très basse, précieux pour la conception de constructions de protéines pour les essais de RMN et de cristallisation. Ces outils sont également utilisés dans la prévision des ligands, les projets de conception et les données cristallographiques en phase. Nous fournissons des modèles de structure de protéines pour la communauté scientifique et initions le criblage in silico de ligands.
- Analyses RMN pour la détermination de structure en solution et les études d'interactions protéines / protéines ou d'acide nucléique / protéine.
- Cristallographie pour résolution de structures à haute résolution.
- Cryomicroscopie électronique et tomographie
- Microscopie à Force atomique (AFM) combinée à la microscopie de localisation de molécules unique et AFM haute vitesse
- Caractérisation biophysique structurale de routine (diffusion de la lumière, dichroïsme circulaire, fluorescence standard). Ces techniques sont des étapes importantes avant les essais de cristallisation, par exemple. L'anisotropie de fluorescence, la fluorescence résolue dans le temps et la calorimétrie de titrage permettent de déterminer les affinités, la thermodynamique et la cinétique des interactions biomoléculaires pour disséquer les relations structure-fonction impliquées dans ces systèmes.
- Spectroscopie de fluorescence avancée (FCS, FCCS, RICS, Number & Brigthness, Fast-FLIM, single molecule FRET en PIE),
- Microscopie de fluorescence avancée (PALM/STORM).
Politique d’accès et de prestations :
Nous donnons également accès à un service production et de biochimie analytique. En effet, un des verrous en biologie structurale et biophysique est l’expression et la production de biomolécules pures et fonctionnelles. Si nécessaire, nos équipements peuvent être utilisés pour la production, la purification et l’analyse, dans le contexte de la plateforme.
La plateforme est ouverte aux chercheurs académiques et aux entreprises. Concernant la politique d’accès, nos utilisateurs peuvent utiliser de façon autonome et payante les équipements. Dans la pratique, la plupart des projets traités dans la plateforme sont complexes et au long cours. Ils prennent ainsi souvent la forme d’une véritable coopération scientifique, impliquant l’expertise complémentaire de nombreux chercheurs et ingénieurs de haut niveau de différents domaines.
La plateforme est labellisée IBiSA et impliquée dans les infrastructures distribuées nationales FRISBI, France BioImaging (PIA) et ChemBioFrance.
Publications
Notes d'applications :
site de la plateforme
Organigramme de la Plateforme PIBBS :
Comité de Direction
- Luca COSTA
- Hélène DEMENE
- Christine DOUCET
- Jean-François GUICHOU
- Gilles LABESSE
- Albane LEMAIRE
- Pierre-Emmanuel MILHIET
- André PADILLA
- Nathalie SIBILLE
+-
Microscopie Electronique (M.E)
Responsable Scientifique :
- Pierre-Emmanuel MILHIET
(DR, CNRS, 5%)
Responsable Technique :
- Joséphine LAI KEE HIM
(IR, CNRS, 50%)
Personnel plateau CDD :
+-
Bio-Informatique
Responsable Scientifique :
- Gilles LABESSE
(DR, CNRS, 25%)
Responsable Technique :
- Jérome GRACY
(IR, CNRS, 50%)
Personnel plateau permanent :
- Violaine MOREAU
(IR, CNRS, 25%)
- Jean-luc PONS
(IR, CNRS, 10%)
+-
Microscopie à force atomique
Responsable Scientifique :
- Luca COSTA
(CR, CNRS, 25%)
Responsable Technique :
- Cedric GODEFROY
(IE, UM, 50%)
+-
Caractérisations Biophysiques
Responsable Scientifique :
- Albane LEMAIRE
(CR, CNRS, 20%)
Responsable Technique :
- Frederic ALLEMAND
(IR, CNRS, 20%)
Personnel plateau permanent :
- Martin COHEN-GONSAUD
(CR, CNRS, 20%)
- François HOH
(IR, CNRS, 10%)
- André PADILLA
(CR, CNRS, 10%)
+-
Biocristallographie (R.X.)
Responsable Scientifique :
- Jean-François GUICHOU
(PU, UM, 30%)
Responsable Technique :
- Muriel GELIN
(IR, CNRS, 30%)
- François HOH
(IR, CNRS, 50%)
Personnel plateau permanent :
- William BOURGUET
(DR, INSERM, 10%)
- Vanessa DELFOSSE
(CR, CNRS, 20%)
+-
R.M.N
Responsable Scientifique :
- André PADILLA
(CR, CNRS, 20%)
- Nathalie SIBILLE
(CR, CNRS, 20%)
Responsable Technique :
- Philippe BARTHE
(IR, UM, 30%)
- Karine DE GUILLEN
(IE, INSERM, 30%)
- Yinshan YANG
(IR, CNRS, 50%)
Personnel plateau permanent :
- Hélène DEMENE
(CR, CNRS, 10%)
- Christian ROUMESTAND
(PU, UM, 20%)
+-
MARS - BioPhotonique
Responsable Scientifique :
- Christine DOUCET
(CR, CNRS, 25%)
Responsable Technique :
- Caroline CLERTE
(IR, INSERM, 25%)
Personnel plateau permanent :
- Jean-Bernard FICHE
(IR, INSERM, 30%)
- Antoine LE GALL
(CR, CNRS, 20%)
- Emmanuel MARGEAT
(DR, CNRS, 10%)
- Robert QUAST
(CR, INSERM, 20%)
+-
PIBBS-CHEMOINFORMATIQUE
Responsable Scientifique :
- Gilles LABESSE
(DR, CNRS, 25%)
Responsable Technique :
- Muriel GELIN
(IR, CNRS, 30%)
+-
Comité de Direction
- Luca COSTA
- Hélène DEMENE
- Christine DOUCET
- Jean-François GUICHOU
- Gilles LABESSE
- Albane LEMAIRE
- Pierre-Emmanuel MILHIET
- André PADILLA
- Nathalie SIBILLE
Microscopie Electronique (M.E)
- Pierre-Emmanuel MILHIET (DR, CNRS, 5%)
Responsable Scientifique :
- Joséphine LAI KEE HIM (IR, CNRS, 50%)
Responsable Technique :
Personnel plateau CDD :
Bio-Informatique
- Gilles LABESSE (DR, CNRS, 25%)
Responsable Scientifique :
- Jérome GRACY (IR, CNRS, 50%)
Responsable Technique :
- Violaine MOREAU (IR, CNRS, 25%)
- Jean-luc PONS (IR, CNRS, 10%)
Personnel plateau permanent :
Microscopie à force atomique
- Luca COSTA (CR, CNRS, 25%)
Responsable Scientifique :
- Cedric GODEFROY (IE, UM, 50%)
Responsable Technique :
Caractérisations Biophysiques
- Albane LEMAIRE (CR, CNRS, 20%)
Responsable Scientifique :
- Frederic ALLEMAND (IR, CNRS, 20%)
Responsable Technique :
- Martin COHEN-GONSAUD (CR, CNRS, 20%)
- François HOH (IR, CNRS, 10%)
- André PADILLA (CR, CNRS, 10%)
Personnel plateau permanent :
Biocristallographie (R.X.)
- Jean-François GUICHOU (PU, UM, 30%)
Responsable Scientifique :
- Muriel GELIN (IR, CNRS, 30%)
- François HOH (IR, CNRS, 50%)
Responsable Technique :
- William BOURGUET (DR, INSERM, 10%)
- Vanessa DELFOSSE (CR, CNRS, 20%)
Personnel plateau permanent :
R.M.N
- André PADILLA (CR, CNRS, 20%)
- Nathalie SIBILLE (CR, CNRS, 20%)
Responsable Scientifique :
- Philippe BARTHE (IR, UM, 30%)
- Karine DE GUILLEN (IE, INSERM, 30%)
- Yinshan YANG (IR, CNRS, 50%)
Responsable Technique :
- Hélène DEMENE (CR, CNRS, 10%)
- Christian ROUMESTAND (PU, UM, 20%)
Personnel plateau permanent :
MARS - BioPhotonique
- Christine DOUCET (CR, CNRS, 25%)
Responsable Scientifique :
- Caroline CLERTE (IR, INSERM, 25%)
Responsable Technique :
- Jean-Bernard FICHE (IR, INSERM, 30%)
- Antoine LE GALL (CR, CNRS, 20%)
- Emmanuel MARGEAT (DR, CNRS, 10%)
- Robert QUAST (CR, INSERM, 20%)
Personnel plateau permanent :
PIBBS-CHEMOINFORMATIQUE
- Gilles LABESSE (DR, CNRS, 25%)
Responsable Scientifique :
- Muriel GELIN (IR, CNRS, 30%)
Responsable Technique :