Analyse de données RNA-seq sous R

Statistiques
Date: mardi 9 mai 2017 - jeudi 11 mai 2017

Lieu: Montpellier

Objectifs:

Comprendre et mettre en oeuvre 3 des logiciels d'analyse de données RNA-seq les plus couramment utilisés pour l'identification de génes différentiellement exprimés.

Responsable scientifique:

Christelle REYNES

Intervenants:

Christelle REYNES, Stéphanie RIALLE, Emeric DUBOIS, Robert SABATIER

Pré-requis:

Statistiques de base pour la génomique

Public:

Chercheurs, ingénieurs, techniciens, doctorants et post-doctorants

Programme:

Jour 1:

  • Matinée : présentation du protocole de séquençage et de traitement RNA-seq (de la construction des banques au comptage), suivi de la présentation des méthodes utilisées par les logiciels DESeq, DESq2 et edgeR
  • Estimation statistique et intervalles de confiance
  • Après-midi : TP prise en main de R.Présentation du jeu de données utilisé les jours suivants.
Jour 2 & 3 :
  • TP analyse complète d'un jeu de données RNA-seq sou R en utilisant DESeq, DESeq2 et edgeR.
  • Contextualisation des données par analyse des termes Gene Ontology (topGO)

Date limite d'inscription:

vendredi 14 avril 2017
La fiche d’inscription est téléchargeable sur cette page :
Veuillez la compléter, la signer, la faire signer par les personnes suivantes (responsable hiérarchique,
directeur d’unité et correspondant formation) et la retourner au contact
(ci-contre).
Désistement : Veuillez avertir le contact(ci-contre) au plus tard 15 jours avant l’atelier.

 

Desistement
Veuillez avertir le contact inscription (ci-dessus) au plus tard 15 jours avant l’atelier
Email
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Téléphone
04.34.35.92.41
Tarif académique
150€ HT €
Tarif privé
350€ HT €

 

Toutes les Dates


  • Du mardi 9 mai 2017 au jeudi 11 mai 2017

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