La plateforme MGX-Montpellier GenomiX offre des technologies de pointe dans le domaine de la génomique aux laboratoires académiques et aux sociétés de biotechnologie.

Portfolio d’applications :

• (re)séquençage de génomes complets, y compris la découverte de variants (SNVs, mutations, indels, CNVs),
• séquençage de régions ciblées du génome, par exemple le séquençage d’exomes,
• analyses transcriptomiques (RNA-seq, smallRNA-seq, microarrays), y compris sur cellules uniques (single cell 3’RNA-seq),
• détermination de la structure et de la dynamique chromatinienne (ChIP-seq, FAIRE-seq, Hi-C),
• analyses épigénétiques (ChIP-seq, RRBS, Bisulfite-seq),
• génotypage (RAD-seq, GBS, microarrays).
  
  

Principale expertise/Services :

Nous avons développé une solide expertise dans les technologies suivantes :

• séquençage "nouvelle génération"
• puces à ADN
• PCR en temps réel à haut débit
• séquençage Sanger spécifique

La plateforme offre également un service complet pour l’analyse des données issues du séquençage nouvelle génération : identification de gènes ou transcrits différentiellement exprimés, cytosines différentiellement méthylées, régions enrichies dans les données de ChIP-seq, variants statistiquement significatifs... Elle peut réaliser la contextualisation fonctionnelle des données.

La plateforme développe également des protocoles à façon pour répondre à des besoins spécifiques et participe à la formation de ses utilisateurs, tant pour la construction des banques que pour l’analyse des données.

Politique d’accès et de prestations :

La plateforme est ouverte aux utilisateurs académiques, cliniques et privés. MGX est labellisée GPTR et IBiSA. Elle est impliquée dans le Cancéropôle Grand Sud-Ouest et fait partie de l’infrastructure nationale France Génomique (PIA).

MGX est certifiée ISO 9001

Publications

Note d'applications :

Site Web de la plateforme

Organigramme de la Plateforme MGX :