Au sein de l’UAR BioCampus, la Plateforme de Protéomique de Montpellier est une structuration régionale des capacités technologiques en analyse protéomique. La plateforme est distribuée sur 4 sites de compétences à proximité immédiate des principaux campus et hôpitaux Montpelliérains (Institut de Génomique Fonctionnelle, Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier, Institut des Sciences des Plantes de Montpellier et Institut de Recherche en Médecine Régénératrice et BioThérapies).

Portfolio d’applications :

  • Identification de protéines (mélanges simple ou complexe),
  • Protéomique quantitative à large échelle,
  • Analyse quantitative ciblée (MRM, PRM),
  • Analyse de modifications post-traductionnelles,
  • Interactomique (AP-MS, BioID, TurboID, APEX/APEX2)
  • Analyses structurales des protéines (topologie et dynamique de complexes protéiques),
  • Découverte et validation de biomarqueurs,
  • Dosage de protéines (immunodosage),
  • Analyse des interactions moléculaires par Résonance Plasmonique de Surface (SPR),
  • Détection et quantification des modifications de l’ARN par spectrométrie de masse,
  • Analyse bioinformatique et statistique des données produites.

Principale expertise/Services :

Le PPM dispose du savoir-faire et des équipements permettant la mise en œuvre de tout type d’approche protéomique à haut et moyen débit. Notre expertise couvre la plupart des technologies actuelles utilisées en protéomique et utilise des approches quantitatives avec marquage (SILAC, TMT/iTRAQ) ou sans marquage (Label-Free).

Nous offrons une gamme complète de service qui inclut :

  • la préparation des échantillons biologiques (purification, séparation, enrichissement et préfractionnement) pour l’analyse par spectrométrie de masse,
  • la protéomique quantitative ciblée et à large échelle,
  • les études interactomiques basées sur la spectrométrie de masse et la résonance plasmonique de surface (SPR),
  • la découverte et la validation de biomarqueurs (basées sur la spectrométrie de masse et sur des approches multiplexées utilisant des anticorps),
  • les études structurales sur protéines entières et complexes,
  • la quantification de modifications des ARN par spectrométrie de masse,
  • les analyses bio-informatiques et statistiques associées,
  • la formation et le conseil aux utilisateurs.

Politique d’accès et de prestations :

Le PPM assure une prise en charge des analyses protéomiques dans le cadre de prestations de service ou de collaborations scientifiques. La sélection des projets est exclusivement fondée sur leur faisabilité technique et la présence d’un financement en adéquation avec les analyses demandées.

La préparation des échantillons pour les analyses est effectuée soit par le personnel de la plateforme soit par l’utilisateur (sur la base des protocoles et formations fournis par la plateforme). Les services sont payants.

Le PPM est labellisé IBiSA et certifié ISO 9001:2015 pour l’ensemble de ses prestations. Le PPM fait partie de l’infrastructure nationale en protéomique ProFI.

Publications

Notes d'applications :

 

 PPM


site de la plateforme


 

Organigramme de la Plateforme PPM :

Direction de la plateforme PPM

    Responsable Scientifique :

  • Martial SEVENO
  • (IR, CNRS, 40%)

    Responsable scientifique adjoint :

  • Christophe HIRTZ
  • (PU, UM, 5%)

    Responsable opérationnel :

  • Jerome VIALARET
  • (IE, CHU, 20%)
+-

Comité de Direction

  • Severine CHAUMONT
  • Christian DUBOS
  • Christophe HIRTZ
  • Alain MANGE
  • Philippe MARIN
  • Martine PUGNIERE
  • Valérie ROFIDAL
  • Martial SEVENO
  • Jerome VIALARET
+-

Comité d'orientation scientifique et technique

    Experts externes :

  • Ludovic BONHOMME
  • (GDEC, Clermont-Ferrand)
  • Pascale COSETTE
  • (Pissaro, Rouen)
  • Chiara GUERRERA
  • (PPN, Paris)
  • Christine SCHAEFFER
  • (LSMBO, Strasbourg)

    Experts locaux :

  • Jérôme DEJARDIN
  • (IGH, Montpellier)
  • Dominique HELMLINGER
  • (CRBM, Montpellier)
  • Hamza MAMERI
  • (IATE, Montpellier)
  • Jérôme MOREAUX
  • (IGH, Montpellier)
  • Bruno ROBERT
  • (IRCM, Montpellier)
+-

Correspondant

  • Responsable Management Qualité : Mathilde DECOURCELLE
  • Communication : Khadija EL KOULALI
  • Developpement durable : Khadija EL KOULALI
  • Communication : Oana VIGY
  • Informatique : Oana VIGY
+-

Protéomique fonctionnelle FPP - IGF

    Responsable Scientifique :

  • Severine CHAUMONT
  • (MC, UM, 15%)
  • Martial SEVENO
  • (IR, CNRS, 60%)

    Responsable Technique :

  • Serge URBACH
  • (IR, CNRS, 100%)

    Personnel plateau permanent :

  • Cherine BECHARA
  • (PU, UM, 10%)
  • Mathilde DECOURCELLE
  • (IE, CNRS, 80%)
  • Khadija EL KOULALI
  • (AI, CNRS, 100%)
  • Oana VIGY
  • (IE, CNRS, 80%)

    Personnel plateau CDD :

  • Tristan GIRBAU
  • (CDD IE, INSERM, 90%)
+-

Spectrométrie de masse protéomique MSPP - IPSiM

    Responsable Scientifique :

  • Christian DUBOS
  • (DR, INRAE, 20%)

    Responsable Technique :

  • Valérie ROFIDAL
  • (AI, INRAE, 100%)

    Personnel plateau permanent :

  • Nathalie BERGER
  • (IE, INRAE, 10%)
  • Vincent DEMOLOMBE
  • (T, INRAE, 100%)
+-

Protéomique clinique PPC

    Responsable Scientifique :

  • Christophe HIRTZ
  • (PU, UM, 20%)

    Responsable Technique :

  • Jerome VIALARET
  • (IE, CHU, 80%)

    Personnel plateau permanent :

  • Alexandre DAVID
  • (DR, INSERM, 10%)
  • Constance DELABY
  • (MC, UM, 10%)
  • Laura FICHTER
  • (IE, CHU, 100%)

    Personnel plateau CDD :

  • Aurore ATTINA
  • (CDD IE, CHU, 100%)
  • Sonia GARCIA-LLORENS
  • (CDD IE, UM, 100%)
  • Nicolas PRADEILLES
  • (CDD T, CHU, 100%)
+-

Protéomique identification & interactions moléculaires PP2I - IRCM

    Responsable Scientifique :

  • Martine PUGNIERE
  • (CR, INSERM, 100%)

    Responsable Technique :

  • Alain MANGE
  • (IR, UM, 30%)

    Personnel plateau CDD :

  • Giang NGO
  • (CDD IE, INSERM, 100%)
+-

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