CONSTRUCTION DE BANQUES & APPLICATIONS

        • RNA-Seq, smallRNA-seq, single cell 3’RNA-Seq (transcriptomique)
        • Bisulfite-Seq, RRBS, ChIP-Seq (épigénétique)
        • ChIP-Seq, FAIRE-Seq, Hi-C (structure chromatinienne)

Contrôle qualité des échantillons, construction de banques.

SÉQUENÇAGE

        • (re)séquençage de génomes complets
        • séquençage de régions ciblées du génome, de cDNAs

Séquençage par synthèse (Illumina), séquençage par nanopores, séquençage Sanger specific.

GÉNOTYPAGE

        • Génotypage microsatellites
        • Génotypage SNP

Extraction de l’ADN, RADseq, GBS, Microarrays

ANALYSES TRANSCRIPTOMIQUES

        • Microarrays
        • qPCR haut débit
        • digital droplet PCR

ANALYSE DES DONNÉES/BIOINFORMATIQUE

        • Identification de variants (SNVs, mutations, CNVs, indels)
        • Identification de cytosines différentiellement méthylées
        • régions enrichies (ChIP-Seq)

PLATEFORMES CONCERNÉES